金税盘抄税清卡流程是：先在开票系统点击抄税处理（上报汇总），然后去税局系统做抄税处理，然后做增值税申报表的填写，审核无误之后提交申报，然后点击扣缴税款，最后在开票系统点击清卡（或者反写）。